福建医科大学是一所以医为主，多学科协调发展，具有完整人才培养体系的福建省“双一流”建设高校，是福建省人民政府和国家卫生健康委员会共建高校，是福建省卫生人才培养中心、医学科学研究中心和医疗卫生服务中心。学校现有临床医学、基础医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、药学、护理学等博士学位授权一级学科6个，临床医学、口腔医学、医学技术等博士专业学位授权点3个；硕士学位授权一级学科9个，硕士专业学位授权点10个。现有临床医学、基础医学、公共卫生与预防医学、药学4个博士后科研流动站，4个博士后工作站，2个院士工作站。临床医学、药理学与毒理学、化学、神经科学与行为学、生物学与生物化学、分子生物学与遗传学、免疫学、材料科学、社会科学总论学科等9个学科进入ESI全球排名前1%，其中临床医学学科进入ESI全球排名前1‰。